የ transmembrane peptides መዋቅራዊ ባህሪያት እና ምደባ

ብዙ አይነት ትራንስሜምብራን peptides አሉ, እና ምደባቸው በአካላዊ እና ኬሚካላዊ ባህሪያት, ምንጮች, የመመገቢያ ዘዴዎች እና ባዮሜዲካል አፕሊኬሽኖች ላይ የተመሰረተ ነው.እንደ ፊዚካዊ እና ኬሚካላዊ ባህሪያቸው, የሜምፕል ፔይንቲን ፔፕቲድዶች በሶስት ዓይነቶች ይከፈላሉ: cationic, amphiphilic and hydrophobic.ካይቲክ እና አምፊፊሊክ ሽፋን ወደ peptides ዘልቆ የሚገባው 85% ሲሆን ሃይድሮፎቢክ ሽፋን ደግሞ peptides 15% ብቻ ይይዛል።

1. የኬቲክ ሽፋን peptide ዘልቆ መግባት

ካይቲክ ትራንስሜምብራን peptides በአርጊኒን ፣ ላይሲን እና ሂስታዲን የበለፀጉ እንደ TAT ፣ Penetratin ፣ Polyarginine ፣ P22N ፣ DPV3 እና DPV6 ያሉ አጫጭር peptides ያቀፈ ነው።ከነሱ መካከል, arginine, ሃይድሮጂን አሉታዊ ክስ phosphoric አሲድ ቡድኖች የሕዋስ ሽፋን ላይ እና transmembrane peptides መካከል የመጠቁ PH ዋጋ ያለውን ሁኔታ ውስጥ ገለፈት ጋር ማገናኘት የሚችል guanidine, ይዟል.የ oligagarginine ጥናቶች (ከ 3 አር እስከ 12 አር) የሜምቡል የመግባት ችሎታ የተገኘው የ arginine መጠን እስከ 8 ዝቅተኛ በሆነበት ጊዜ ብቻ ነው ፣ እና የአርጊኒን መጠን በመጨመር የሽፋኑ የመግባት ችሎታ ቀስ በቀስ ይጨምራል።ላይሲን ምንም እንኳን እንደ አርጊኒን አይነት ካቲኒክ ቢሆንም ጓኒዲንን አልያዘም ስለዚህ ብቻውን ሲኖር የሜምቡል የመግባት ብቃቱ በጣም ከፍተኛ አይደለም።ፉታኪ እና ሌሎች.(2001) ጥሩ የሜምፕል ዘልቆ ውጤት ሊገኝ የሚችለው የ cationic cell membrane penetrating peptide ቢያንስ 8 አዎንታዊ አሚኖ አሲዶች ሲይዝ ብቻ ነው።ምንም እንኳን አዎንታዊ ቻርጅ የተደረገባቸው የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች ወደ ገለባው ውስጥ ዘልቀው ለመግባት ለሚችሉ peptides በጣም አስፈላጊዎች ቢሆኑም ሌሎች አሚኖ አሲዶችም እንዲሁ ጠቃሚ ናቸው፣ ለምሳሌ W14 ወደ F ሲቀየር የፔኔትራቲን የፔኔትራቲን አቅም ይጠፋል።

ልዩ የ cationic transmembrane peptides ክፍል የኑክሌር አከባቢ ቅደም ተከተል (NLSs) ሲሆን ይህም በአርጊኒን ፣ ላይሲን እና ፕሮሊን የበለፀጉ አጫጭር peptides ያቀፈ እና በኑክሌር ቀዳዳ ውስብስብ በኩል ወደ ኒውክሊየስ ሊጓጓዝ ይችላል።ኤንኤልኤስ የበለጠ ወደ ነጠላ እና ድርብ ትየባ ሊከፋፈሉ ይችላሉ፣ እንደቅደም ተከተላቸው አንድ እና ሁለት ዘለላዎች ያሉት መሰረታዊ አሚኖ አሲዶች።ለምሳሌ፣ PKKRKV from simian virus 40(SV40) አንድ ነጠላ NLS ትየባ ሲሆን የኑክሌር ፕሮቲን ደግሞ NLS ድርብ ትየባ ነው።KRPAATKKAGQAKKL በ membrane transmembrane ውስጥ ሚና መጫወት የሚችል አጭር ቅደም ተከተል ነው።አብዛኛዎቹ ኤንኤልኤስዎች ከ 8 ያነሱ የኃይል መሙያ ቁጥሮች ስላሏቸው NLSs ውጤታማ transmembrane peptides አይደሉም፣ ነገር ግን ከሃይድሮፎቢክ ፔፕታይድ ቅደም ተከተሎች ጋር በመተባበር አምፊፊል ትራንስሜምብራን peptides ሲፈጠሩ ውጤታማ ትራንስሜምብራን peptides ሊሆኑ ይችላሉ።

መዋቅራዊ-2

2. Amphiphilic transmembrane peptide

Amphiphilic transmembrane peptides ሃይድሮፊሊክ እና ሃይድሮፎቢክ ጎራዎችን ያቀፈ ሲሆን እነዚህም ወደ አንደኛ ደረጃ አምፊፊሊክ ፣ ሁለተኛ α-ሄሊካል አምፊፊሊክ ፣ β-folding amphiphilic እና prolin-የበለፀገ አምፊፊሊክ ሊከፋፈሉ ይችላሉ።

ቀዳሚ ዓይነት አምፊፊሊክ ይልበሱ ሽፋን peptides በሁለት ምድቦች ይከፈላል ፣ ከኤንኤልኤስ ጋር በሃይድሮፎቢክ peptide ቅደም ተከተል የተገናኘ ፣ እንደ MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKRKV) እና ፔፕ - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV) ፣ ሁለቱም በኑክሌር አከባቢ ምልክት PKKKRKV ውስጥ በ SV40 ውስጥ የተመሰረቱ ናቸው ። የMPG ጎራ ከኤችአይቪ glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) ውህደት ቅደም ተከተል ጋር ይዛመዳል እና የፔፕ-1 ሃይድሮፎቢክ ጎራ ከ tryptophan ሀብታም ክላስተር ከፍተኛ ሽፋን ካለው (KETWWET WWTEW) ጋር ይዛመዳል።ነገር ግን፣ የሁለቱም ሀይድሮፎቢክ ጎራዎች ከኑክሌር አከባቢ ምልክት PKKKRKV በ WSQP በኩል የተገናኙ ናቸው።ሌላው የአንደኛ ደረጃ አምፊፊሊክ ትራንስሜምብራን peptides ከተፈጥሯዊ ፕሮቲኖች ተለይቷል፣ ለምሳሌ pVEC፣ ARF(1-22) እና BPrPr(1-28)።

የሁለተኛ ደረጃ α-helical amphiphilic transmembrane peptides በ α-helices በኩል ከሽፋኑ ጋር ይጣመራሉ, እና የሃይድሮፊሊክ እና የሃይድሮፎቢክ አሚኖ አሲድ ቅሪቶች በተለያዩ የሂሊካል መዋቅር ገጽታዎች ላይ ይገኛሉ, ለምሳሌ MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).ለ beta peptide folding type amphiphilic wear membrane፣ የቤታ ፕሌትድ ሉህ የመቅረጽ ችሎታው ወደ ሽፋኑ የመግባት አቅሙ ወሳኝ ነው፣ ለምሳሌ በ VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) የገለባውን የመግባት አቅም በማጥናት ሂደት፣ አይነት ዲ በመጠቀም - የአሚኖ አሲድ ሚውቴሽን አናሎግ ቤታ የታጠፈ ቁራጭ መፍጠር አልቻለም ፣ የሽፋኑ የመግባት ችሎታ በጣም ደካማ ነው።በፕሮላይን የበለጸጉ አምፊፊሊክ ትራንስሜምብራን peptides ውስጥ, ፖሊፕሮሊን II (PPII) በቀላሉ በንጹህ ውሃ ውስጥ በቀላሉ የሚፈጠረው ፕሮቲን በ polypeptide መዋቅር ውስጥ በጣም የበለፀገ ነው.ፒፒአይአይ በግራ እጅ ሄሊክስ ሲሆን በአንድ ተራ 3.0 አሚኖ አሲድ ቅሪት ነው፣ ከመደበኛው የቀኝ እጅ የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር በተቃራኒ 3.6 አሚኖ አሲድ ቀሪዎች።በፕሮላይን የበለፀጉ አምፊፊሊክ ትራንስሜምብራን peptides ቦቪን ፀረ-ተሕዋስያን peptide 7 (Bac7) ፣ ሠራሽ ፖሊፔፕታይድ (PPR) n (n 3 ፣ 4 ፣ 5 እና 6) ወዘተ ያካትታል ።

መዋቅራዊ-3

3. የሃይድሮፎቢክ ሽፋን peptide ዘልቆ መግባት

Hydrophobic transmembrane peptides የዋልታ ያልሆኑ አሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ብቻ ይይዛሉ ፣ የተጣራ ክፍያ ከጠቅላላው የአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ከ 20% ያነሰ ፣ ወይም ለትራንስሜምብራን አስፈላጊ የሆኑ ሃይድሮፎቢክ አካላትን ወይም የኬሚካል ቡድኖችን ይዘዋል ።ምንም እንኳን እነዚህ ሴሉላር ትራንስሜምብራን peptides ብዙውን ጊዜ በቸልታ ቢታዩም እንደ ፋይብሮብላስት የእድገት ፋክተር (K-FGF) እና ፋይብሮብላስት እድገት ፋክተር 12 (F-GF12) ከካፖዚ ሳርኮማ ያሉ አሉ።


የልጥፍ ጊዜ: ማርች-19-2023