በፔፕታይድ ብጁ ውህደት ውስጥ የፔፕታይድ ቦንድ ምስረታ መርህ እንዴት ነው?

ላይ ላዩን, peptide ቦንድ ምስረታ, የሚያፈራ dipeptides, ቀላል ኬሚካላዊ ሂደት ነው.ይህ ማለት ሁለቱ የአሚኖ አሲድ ክፍሎች በፔፕታይድ ቦንድ፣ በአሚድ ቦንድ፣ በድርቀት እየተሟጠጡ ይገናኛሉ።

የፔፕታይድ ቦንድ ምስረታ በትንሽ ምላሽ ሁኔታዎች ውስጥ የአሚኖ አሲድ ማግበር ነው።(ሀ) የካርቦክሳይል አካል፣ ሁለተኛ አሚኖ አሲድ (ቢ) ኑክሊዮፊል የነቃው የካርቦክሲል ክፍል ከዚያም ዲፔፕታይድ (AB) ይፈጥራል።"የካርቦክሳይል ክፍል (A) ካልተጠበቀ የፔፕታይድ ቦንድ ምስረታ ቁጥጥር ሊደረግበት አይችልም."እንደ መስመራዊ እና ሳይክሊክ peptides ያሉ ተረፈ ምርቶች ከዒላማ ውህዶች AB ጋር ሊዋሃዱ ይችላሉ።ስለዚህ ሁሉም በፔፕታይድ ቦንድ ምስረታ ውስጥ ያልተሳተፉ ሁሉም የተግባር ቡድኖች በፔፕታይድ ውህደት ጊዜያዊ በሆነ መንገድ ሊጠበቁ ይገባል.

ስለዚህ, የፔፕታይድ ውህደት - የእያንዳንዱ የፔፕታይድ ትስስር መፈጠር - ሶስት ደረጃዎችን ያጠቃልላል.

የመጀመሪያው እርምጃ ጥበቃ የሚያስፈልጋቸው አንዳንድ አሚኖ አሲዶችን ማዘጋጀት ነው, እና የአሚኖ አሲዶች ዝዊተሪዮኒክ መዋቅር ከአሁን በኋላ የለም.

ሁለተኛው እርምጃ የፔፕታይድ ቦንዶችን ለመመስረት የሁለት-ደረጃ ምላሽ ነው ፣ በ N-የተጠበቀው አሚኖ አሲድ የካርቦክሳይል ቡድን በመጀመሪያ ወደ ንቁ መካከለኛ እና ከዚያም የፔፕታይድ ትስስር ይፈጠራል።ይህ የተጣመረ ምላሽ እንደ አንድ-ደረጃ ምላሽ ወይም እንደ ሁለት ተከታታይ ምላሾች ሊከሰት ይችላል።

ሦስተኛው እርምጃ የመከላከያውን መሠረት መምረጥ ወይም ሙሉ በሙሉ ማስወገድ ነው.ምንም እንኳን ሁሉም ማስወገጃዎች ሊከሰቱ የሚችሉት ሁሉም የፔፕታይድ ሰንሰለቶች ከተሰበሰቡ በኋላ ብቻ ነው, የፔፕታይድ ውህደትን ለመቀጠል የመከላከያ ቡድኖችን መምረጥም ያስፈልጋል.

ምክንያቱም 10 አሚኖ አሲዶች (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec and Cys) የጎን ሰንሰለት ተግባራዊ ቡድኖችን ስለያዙ የፔፕታይድ ውህደት ይበልጥ የተወሳሰበ እንዲሆን በማድረግ የተመረጠ ጥበቃ ያስፈልገዋል።ጊዜያዊ እና ከፊል-ቋሚ የመከላከያ መሰረቶች ተለይተው የሚታወቁት ለምርጫ የተለያዩ መስፈርቶች ምክንያት ነው.ጊዜያዊ ጥበቃ ቡድኖች የአሚኖ አሲድ ወይም የካርቦክሲል ተግባራዊ ቡድኖች ጊዜያዊ ጥበቃን ለማንፀባረቅ በሚቀጥለው ደረጃ ጥቅም ላይ ይውላሉ.ከፊል-ቋሚ መከላከያ ቡድኖች ቀደም ሲል በተፈጠሩት የፔፕታይድ ቦንዶች ወይም የአሚኖ አሲድ የጎን ሰንሰለቶች ውስጥ ጣልቃ ሳይገቡ ይወገዳሉ, አንዳንድ ጊዜ በማዋሃድ ጊዜ.

"በሀሳብ ደረጃ፣ የካርቦክሳይል ንጥረ ነገርን ማንቃት እና የፔፕታይድ ቦንዶች መፈጠር (ተያያዥ ምላሾች) ፈጣን መሆን አለበት፣ ያለ ዘር ወይም ከምርት ምስረታ፣ እና ከፍተኛ ምርት ለማግኘት ሞላር ሪአክተሮች መተግበር አለባቸው።"በሚያሳዝን ሁኔታ, የትኛውም የኬሚካላዊ ትስስር ዘዴዎች እነዚህን መስፈርቶች አያሟሉም, እና ጥቂቶቹ ለተግባራዊ ውህደት ተስማሚ ናቸው.

በፔፕታይድ ውህደት ወቅት በተለያዩ ምላሾች ውስጥ የተካተቱት የተግባር ቡድኖች አብዛኛውን ጊዜ ከመመሪያው ማእከል ጋር ይገናኛሉ, ግሊሲን ብቸኛው ልዩነት ነው, እና የመዞር አደጋ አለ.

በፔፕታይድ ውህደት ዑደት ውስጥ የመጨረሻው ደረጃ ሁሉንም የመከላከያ ቡድኖች መወገድ ነው.በዲፔፕታይድ ውህደት ውስጥ መከላከያን ሙሉ በሙሉ ለማስወገድ ከሚያስፈልጉት መስፈርቶች በተጨማሪ የመከላከያ ቡድኖችን መምረጥ ለ peptide ሰንሰለት ማራዘሚያ አስፈላጊ ነው.ሰው ሰራሽ ስልቶች በጥንቃቄ መታቀድ አለባቸው።በስትራቴጂካዊ ምርጫ ላይ በመመስረት N የ α-አሚኖ ወይም የካርቦክሲል መከላከያ ቡድኖችን በመምረጥ ማስወገድ ይችላል.“ስልት” የሚለው ቃል የሚያመለክተው የግለሰብ አሚኖ አሲዶች የኮንደንስሽን ምላሽ ቅደም ተከተል ነው።በአጠቃላይ, ቀስ በቀስ ውህድ እና ቁርጥራጭ ኮንዲሽን መካከል ልዩነት አለ.የፔፕታይድ ውህደት ("ተለምዷዊ ውህደት" በመባልም ይታወቃል) በመፍትሔ ውስጥ ይከናወናል.በአብዛኛዎቹ ሁኔታዎች የፔፕታይድ ሰንሰለትን ቀስ በቀስ ማራዘም የሚቻለው የፔፕታይድ ሰንሰለት በመጠቀም አጫጭር ቁርጥራጮችን በማዋሃድ ብቻ ነው።ረዣዥም peptidesን ለማዋሃድ የታለመው ሞለኪውሎች ወደ ተገቢ ቁርጥራጮች መከፋፈል እና በ C ተርሚነስ ላይ ያለውን የልዩነት መጠን መቀነስ እንደሚችሉ መወሰን አለባቸው።የነጠላ ቁርጥራጮች ቀስ በቀስ ከተሰበሰቡ በኋላ, የታለመው ድብልቅ ወደ ላይ ይጣመራል.የፔፕታይድ ውህደት ስትራቴጂው በጣም ጥሩውን እና በጣም ትክክለኛ የሆነውን የመከላከያ ቁርጥራጭን መምረጥን ያካትታል, እና የፔፕታይድ ውህደት ስልት በጣም ተስማሚ የሆኑ የመከላከያ መሠረቶችን እና በጣም ጥሩውን የስብስብ ውህደት ዘዴን ያካትታል.