የንድፍ እቅድ እና የ polypeptide peptide ሰንሰለት መፍትሄ

I. ማጠቃለያ
Peptides በኬሚካላዊ እና በአካላዊ ባህሪያቸው ውስጥ ቅደም ተከተላቸው ያልተለመደ ስለሆነ ልዩ ማክሮ ሞለኪውሎች ናቸው.አንዳንድ peptides ለመዋሃድ አስቸጋሪ ናቸው, ሌሎች ደግሞ በአንፃራዊነት ቀላል ናቸው ነገር ግን ለማጣራት አስቸጋሪ ናቸው.ተግባራዊ ችግር አብዛኞቹ peptides በውኃ መፍትሄዎች ውስጥ በትንሹ የሚሟሙ ናቸው, ስለዚህ የእኛ የመንጻት ውስጥ, hydrophobic peptide ያለውን ተዛማጅ ክፍል ያልሆኑ aqueous መሟሟት ውስጥ መሟሟት አለበት, ስለዚህ, እነዚህ መሟሟት ወይም ቋት አጠቃቀሙ ጋር በጣም የሚቃረን ሊሆን ይችላል. የባዮሎጂካል የሙከራ ሂደቶች, ስለዚህ ቴክኒሻኖች ፔፕታይድ ለራሳቸው ዓላማ እንዳይጠቀሙ በጥብቅ የተከለከሉ ናቸው, ስለዚህም የሚከተሉት ለተመራማሪዎች የ peptides ንድፍ በርካታ ገፅታዎች ናቸው.

የንድፍ እቅድ እና የ polypeptide peptide ሰንሰለት መፍትሄ
ሁለተኛ, ሰው ሠራሽ አስቸጋሪ peptides ትክክለኛ ምርጫ
1. የታች-ቁጥጥር ቅደም ተከተሎች ጠቅላላ ርዝመት
ከ 15 ያነሱ ቅሪቶች ፔፕቲዶች ለማግኘት ቀላል ናቸው, ምክንያቱም የፔፕታይድ መጠን ስለሚጨምር እና የንጹህ ምርቱ ንፅህና ይቀንሳል.የፔፕታይድ ሰንሰለት አጠቃላይ ርዝመት ከ20 ቅሪቶች በላይ ሲጨምር፣ ትክክለኛው የምርት መጠን ቁልፍ ጉዳይ ነው።በብዙ ሙከራዎች ውስጥ የተረፈውን ቁጥር ከ 20 በታች ዝቅ በማድረግ ያልተጠበቁ ውጤቶች ማግኘት ቀላል ነው.
2. የሃይድሮፎቢክ ቀሪዎችን ቁጥር ይቀንሱ
ከፍተኛ የሃይድሮፎቢክ ቅሪቶች ያላቸው Peptides ፣ በተለይም በክልል ውስጥ ከ 7-12 ቅሪቶች ከ C-terminus ፣ ብዙውን ጊዜ ሰው ሠራሽ ችግሮችን ያስከትላሉ።ይህ በትክክል እንደ በቂ ያልሆነ ጥምረት ነው የሚታየው ምክንያቱም የ B-fold ሉህ በቅንጅቱ ውስጥ ስለተገኘ ነው."በእንደዚህ አይነት ሁኔታዎች ከሁለት በላይ አወንታዊ እና አሉታዊ ቅሪቶችን መቀየር ወይም የፔፕታይድ ቅንብርን ለመክፈት Gly ወይም Proን ወደ peptide ውስጥ ማስገባት ጠቃሚ ሊሆን ይችላል."
3. "አስቸጋሪ" ቅሪቶችን መቀነስ
"በአጠቃላይ በቀላሉ ያልተዋሃዱ በርካታ የሳይስ፣ ሜት፣ አርግ እና ትሪ ቀሪዎች አሉ።"ሰር በተለምዶ ለሳይስ እንደ nonoxidative አማራጭ ጥቅም ላይ ይውላል።
የንድፍ እቅድ እና የ polypeptide peptide ሰንሰለት መፍትሄ

ሦስተኛ, በውሃ ውስጥ የሚሟሟ ትክክለኛውን ምርጫ አሻሽል
1. N ወይም C ተርሚኑን ያስተካክሉ
ከአሲዳማ peptides አንጻራዊ (ማለትም በ pH 7 ላይ አሉታዊ ተሞልቷል)፣ አሲቴላይዜሽን (N-terminus acetylation፣C terminus ሁልጊዜ ነፃ የካርቦክሲል ቡድንን ይይዛል) በተለይ አሉታዊ ክፍያውን ለመጨመር ይመከራል።ይሁን እንጂ ለመሠረታዊ peptides (ይህም በ pH 7 ላይ አዎንታዊ ክፍያ), አሚን (ነጻ አሚኖ ቡድን በ N-terminus እና amination በ C-terminus) በተለይ አወንታዊ ክፍያን ለመጨመር ይመከራል.

2. ቅደም ተከተሎችን በከፍተኛ ሁኔታ ያሳጥሩ ወይም ያራዝሙ

አንዳንድ ቅደም ተከተሎች እንደ Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr እና Ala, ወዘተ የመሳሰሉ ከፍተኛ ቁጥር ያላቸው ሃይድሮፎቢክ አሚኖ አሲዶች ይይዛሉ.የፔፕታይድ አወንታዊ እና አሉታዊ ምሰሶዎችን የበለጠ ለመጨመር ቅደም ተከተል ማራዘም ጠቃሚ ሊሆን ይችላል.ሁለተኛው አማራጭ የሃይድሮፎቢክ ቀሪዎችን በማስተካከል አወንታዊ እና አሉታዊ ምሰሶዎችን ለመጨመር የፔፕታይድ ሰንሰለት መጠንን መቀነስ ነው.የፔፕታይድ ሰንሰለቱ አወንታዊ እና አሉታዊ ጎኖች በይበልጥ ከውሃ ጋር ምላሽ የመስጠት ዕድሉ ከፍተኛ ነው።
3. በውሃ ውስጥ የሚሟሟ ቅሪት ውስጥ ያስቀምጡ
ለአንዳንድ የፔፕታይድ ሰንሰለቶች የአንዳንድ አወንታዊ እና አሉታዊ የአሚኖ አሲዶች ጥምረት የውሃ መሟሟትን ያሻሽላል።ኩባንያችን N-terminus ወይም C-terminus የአሲድ-ፔፕቲዶችን ከግሉ-ግሉ ጋር እንዲዋሃድ ይመክራል።የመሠረታዊው የ peptide N ወይም C ተርሚነስ ተሰጥቷል ከዚያም Lys-lys.የተከሰሰው ቡድን መቀመጥ ካልቻለ፣ Ser-Gly-Ser በ N ወይም C ተርሚነስ ውስጥም ሊቀመጥ ይችላል።ይሁን እንጂ የፔፕታይድ ሰንሰለት ጎኖች ሊለወጡ በማይችሉበት ጊዜ ይህ አካሄድ አይሰራም.